São José dos Ausentes är en kommun i Brasilien. Den ligger i delstaten Rio Grande do Sul, i den södra delen av landet, 1,400 km söder om huvudstaden Brasília. Antalet invånare är 3,290.
I omgivningarna runt São José dos Ausentes växer i huvudsak städsegrön lövskog. Runt São José dos Ausentes är det glesbefolkat, med 15 invånare per kvadratkilometer. Klimatet i området är fuktigt och subtropiskt. Årsmedeltemperaturen i trakten är 17 °C. Den varmaste månaden är januari, då medeltemperaturen är 20 °C, och den kallaste är juli, med 12 °C. Genomsnittlig årsnederbörd är 2,148 millimeter. Den regnigaste månaden är februari, med i genomsnitt 341 mm nederbörd, och den torraste är maj, med 71 mm nederbörd.
